中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組所張興坦研究員應(yīng)邀到亞熱帶生態(tài)所開展學(xué)術(shù)交流

　　6月11日，應(yīng)中國科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所畜禽健康養(yǎng)殖與農(nóng)牧復(fù)合生態(tài)研究中心印遇龍院士的邀請，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組所張興坦研究員到所開展交流，并作學(xué)術(shù)報告。報告會由畜禽健康養(yǎng)殖與農(nóng)牧復(fù)合生態(tài)研究中心副研究員段葉輝主持。

　　張興坦研究員作了題為“Implication of sequencing tea genomes”的報告。他介紹了茶樹基因組研究進(jìn)展，從草圖水平到染色體級別，再到單倍型分型組裝；利用獨立開發(fā)的新算法攻克高雜合、高重復(fù)鐵觀音基因組組裝難題-ALLHiC算法，研究發(fā)現(xiàn)大葉茶與小葉茶存在不同的演化和馴化歷史；最后，闡述了等位基因不平衡、茶樹群體演化和人工馴化歷史等相關(guān)科學(xué)問題。

　　報告結(jié)束后，與會人員圍繞沙子嶺豬的基因圖譜數(shù)據(jù)分析與其他相關(guān)性問題展開了交流與討論。

　　印遇龍院士提出，要對沙子嶺豬的基因圖譜數(shù)據(jù)項目方案進(jìn)行完善，并明確了雙方今后的合作方向，以期能進(jìn)一步豐富對我國地方豬優(yōu)良肉質(zhì)性狀形成機(jī)制的認(rèn)識，更好地助推沙子嶺豬的產(chǎn)業(yè)化發(fā)展。

　　專家簡介：

　　張興坦，研究員、博士生導(dǎo)師，國家基金委優(yōu)秀青年基金獲得者。研究方向為復(fù)雜多倍體/高雜合二倍體基因組組裝和分型方法的開發(fā)、基于NGS或單分子測序技術(shù)開發(fā)生物信息分析算法和工具、基于組學(xué)大數(shù)據(jù)挖掘植物重要功能基因并解析其生物學(xué)機(jī)制。長期致力于植物功能基因組學(xué)研究，研究領(lǐng)域包括復(fù)雜基因組的組裝和分型、生物信息分析技術(shù)的開發(fā)、基于組學(xué)大數(shù)據(jù)挖掘重要功能基因等，開發(fā)ALLHiC算法解決同源多倍體染色體分型難題，并破譯第一個同源多倍體甘蔗基因組；破譯多個榕樹基因組，組裝和分型X和Y性染色體，揭示榕屬性別決定因子、氣生根形成機(jī)制、榕蜂協(xié)同演化、雜交漸滲對其物種快速形成的機(jī)制等科學(xué)問題。研究成果以第一或通訊作者（含共同）在Cell、Nature、Nature Genetics、Nature Plants、Nature Communications等高水平期刊發(fā)表。

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